鉴于航空兵力已经全灭而水面舰艇又尚未为一场舰队决战集结完毕，山本试图重新配置他那在数量上仍旧强大的舰队来埋伏美军舰艇。但是他原来的计划将水面舰艇配置得过于远离中途岛，而且美军指挥官雷蒙德斯普鲁恩斯海军中将基于一份来自美国潜艇staborss198的错误报告，以为岛仍要进攻中途岛，谨慎地早早向东撤退而并未中伏。斯普鲁恩斯并不知道岛阵列中拥有包括大和号在内的数艘战列舰，如果在中途岛进行夜战他的航母和巡洋舰将处于不利的位置。向东确实防止了这类夜战的发生。此时山本准确地判断他已没有胜算，遂宣布放弃占领中途岛的任务并全军撤退。这次失败使山本持续六个月的成功历程告一段落，岛的扩张也到此为止。

山本的中途岛作战此后广受指责。批评意见认为山本违反了军事作战“集中兵力”的基本原则，而且作战计划过于复杂。但也有意见指出盟军也实施过复杂程度不相上下的作战而且获得成功，并将失败的原因归咎于美军破译岛密码，在事先已对山本的计划洞若观火。但若山本没有驳回南云提出的在空袭前先进行侦察的的请求，便可以抵消美军破译密码并埋伏航母所获得的优势。

残酷的消耗战，中途岛战役的失败阻碍了岛的推进，但岛国海军仍拥有相当实力，还有重新获得主动权的机会。他们制定了“fs作战”试图占领萨摩亚群岛和斐济以便切断澳大利亚与美国的联系，如此一来便可削弱道格拉斯麦克阿瑟上将和他的美澳联合部队所带来的威胁。于是，山本和他的对手欧内斯特金海军上将都将注意力转向瓜岛上的机场。

金上将向美国参谋长联席会议建议立刻对日军发动反击，避免日军重新掌握主动权。于是，1942年8月美国海军陆战队突袭瓜岛并将该处的岛击溃，由此引发了一场持续到1943年2月的长期消耗战，将岛国拖得苦不堪言。

岛队经过过甲午战争和日俄战争，而从这两场战争中岛国人很莫名其妙地把战争和战斗给混淆了起来，认为只要取得一次关键战斗的胜利，整个战争就算胜利了，这就是岛国陆军和海军共有的“决战”概念。从太平洋战争开始以后，岛国人就一直在寻找这种“决战”的机会，这次大家都确认了这个瓜岛就是日美决战的舞台，岛国只要赢得了瓜岛，美国鬼畜就必须低下头来乖乖和大岛国帝国谈判。于是山本又开始了他的决战计划。瓜岛被占据时，岛正过度扩张，意图在守卫中太平洋防线的同时攻取新几内亚、准备fs作战。为了兼顾新几内亚作战和瓜岛战役，fs作战被放弃了。岛的过度扩张导致他们持续地缺乏运力，缺乏部队，而陆军与海军之间仍旧难以配合。

山本指挥联合舰队实施了几次迟滞美军行动的作战，但造成的损失却是他难以承担的。在9、10月间，为支援在瓜岛作战的陆军部队，爆发了两场由山本亲自指挥的航母交战：东所罗门海战和圣克鲁斯海战，并在11月为炮击瓜岛机场爆发了一连两次被称为瓜达尔卡纳尔海战的惨烈夜战，联合舰队损失了两艘金刚级战列舰。由于海军无法为陆军提供足够的后勤保障，导致无法顺利达成目标，每次作战计划都遭到扰乱。山本的舰队对美军造成了严重的损失，最严重的时候美军只剩下企业号一艘航母，但他所期待的决定性胜利则一直没有发生。反而，岛国海军的精锐被逐渐消耗殆尽。

在上述航母交战中岛航母俯冲轰炸机及鱼雷轰炸机损失惨重，使岛更严重地缺乏舰载机机组。在受到良好训练的补充飞行员这方面岛无法与美军抗衡，而且无论是陆基还是舰载飞行员的素质都在下降。但是尤为有害的，则是在愚蠢的东京快车行动中丧失了大量的驱逐舰。岛本已感觉到这类轻型作战舰艇数量不足，瓜岛战役中的损失则令岛商船队的护航力量进一步削弱。1943年2月瓜岛被美军完全占领，岛国海军再无多余力量在所罗门群岛发动大规模行动。

到瓜岛作战结束为止，基本上是联合舰队先任参谋黑岛龟人大佐在拟定作战计划，但作战失败的责任则应该由信任，重用黑岛，批准黑岛的计划的联合舰队司令长官山本五十六来负，因为黑岛从来没有过像陆军参谋常有的那种自作主张的行为，应该说他的计划是忠实地反映了山本五十六的敌情判断和作战目的。而且山本五十六在瓜岛作战时和军令部也没有发生过冲突，就是说岛国海军作为一个整体保持了高度的一致。

中途岛一战，岛国海军失去了在航空母舰的上的优势；瓜岛的半年，岛国陆海军被美国人强迫出血，除了陆军的炮灰以外，海军失去了两艘战列舰，和大量的驱逐舰，舰载机，陆基机和优秀的飞行员，而这些是岛国的工业能力和教育能力所无法弥补的。但作为联合舰队司令长官的山本五十六不能公开承认失败，只能死中求活。在山本看来唯一可行的方法是如果在美军大举进攻之前能够争取到巩固岛的防守阵势的时间的话，那么延缓美军进攻的速度还是有可能的，随着时间的流逝，天照大神还是有可能再次对日本微笑的。

再赌一次，山本五十六下定了决心。所以山本五十六发动了“号作战”。

山本发动“号作战”的目的非常简单，就是争取一点岛国人整顿防线的时间。这一点无可厚非，但是问题是山本五十六发动的这个号作战”实在太逸出了常规。山本害怕航母的损失，居然荒唐的要航母飞行员转陆地进行突击，将第三舰队的舰载机拉上岸，从陆地机场上起飞去作战，这样万一作战失利也就是损失几架飞机，航母本身没有危险。现山本粉丝们都不肯承认这种异想天开的作战方式是山本五十六的发明，举出了一大堆名字来寻找嫌疑犯，其实没有这种必要。从海军军人的回忆录里可以看到，第三舰队的下层军官激烈地反对这个莫名其妙的作战计划，甚至第三舰队司令部的参谋们也不赞成这个计划。但是小泽治三郎没有反对过，联合舰队司令部里也没有过任何有关号作战”的争论，就是说联合舰队司令部的参谋们都知道这是长官的决定，“号作战”从4月7日开始进行，参加的除了第三舰队的184架舰载机以外，还有第11航空舰队的88架零战，27架九九式舰爆和72架一式陆攻，4架侦

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